Die Zeitschrift beschäftigt sich mit allen wirtschaftshistorischen und sozialhistorischen Phänomenen seit dem Ausgang der Spätantike bis heute und erscheint seit 1967 jährlich mit zwei Heften oder einem Band (als einem Doppelheft). Teilweise reich bebildert, mit Karten und Skizzen, enthält die Zeitschrift Beiträge aus allen Bereichen der Wirtschafts- und Sozialgeschichte mit Zusammenfassungen in englischer und französischer Sprache.

Zur Gründungsgeschichte der Zeitschrift Scripta Mercatura und ihrem ersten Herausgeber Theodor Gustav Werner vgl. H. Kellenbenz' Hommage an „Theodor Gustav Werner und die Zeitschrift ‚Scripta Mercaturae‘“, VSWG 62. 3 (1975), 391–412.